啟秀寺位于安徽省宿松縣長江北岸小孤山巔。寺院依山構筑，巧奪天工。周圍峰巒疊翠，巖壑清幽。啟秀寺始建于唐朝玄宗年間（約750年前后）。禪宗名僧馬祖道一曾卓錫于此，命寺名為“啟秀”。北宋時期重建，改名“慧濟寺”。后遭毀圮。清咸豐七年進行了一次較大規模的修整。該寺為省級重點開放寺院。法系屬禪宗。

啟秀寺建筑多為古代所遺留，現尚保存完好，主要有山門、彌勒閣、凌虛閣、牧羊亭（梳妝亭）等。梳妝亭坐落于小孤山絕頂之上，臨空遠眺，景色佳絕。寺內重要文物有銅香爐、瓷瓶、錫壺等，其中定風爐為唐朝之物。另有宋元各時期碑刻九塊。珍藏《大藏經》一部，為1992年臺灣體通法師所贈。

小孤山的寺廟，始建于唐代。當時中國佛教興盛，禪宗馬祖道一(709-788年)云游天下名山，行腳至星子縣的龔公山，宿松的靈隱山一帶傳授佛法，后以小孤秀過靈隱，便至此開山建廟，曰“啟秀寺”。其弟子“百丈清規”的創始人懷海，世稱百丈禪師，于唐德宗時曾到此寺講法，傳下了《禪門規式》。故《山譜》上有“馬祖開山，百丈傳規”的記載。

相傳，唐時山上寺廟很是狹小，內朔一男形神象，姓氏不詳，無從考記。廟在盛唐后，日見荒蕪，從顧況的“古廟楓林江水邊，寒鴉接飯雁橫天，大孤山遠小孤出，月照洞庭歸客船”的詩句中即可想見當時的概貌。晚唐時，幾經兵亂，寺廟一度破毀。

北宋時期，廟重建。改名“惠濟寺”始祀海神媽祖，即現在所稱的小姑娘娘。據《清一統志》稱：“天后，宋莆田林愿第六女，始生有祥光異香，長能乘法席渡海，乘云游島嶼間，升化后常飛翻海上，專司救助海難。宋、元、明、清時，累著靈跡”。故宋代在此立廟祀之，并對女神一再加封，給她以“助順安濟廣濟惠濟夫人”的稱號。如此一來，由馬祖開山變成了媽祖，像由男形變成女形。南宋紹興初，魏國公張俊從湖湘還，曾對小孤山寺廟加以修葺，擴建為六重，規模宏敞。廟前額曰“惠濟”神號“安濟夫人”并有碑載其事。寶慶二年(1226)江洲守臣厲文翁又在山巔上建“牧羊亭”并筑有石級可登。

元代以海運效靈，又對小孤山寺廟略加修葺，賜額“廣濟”給女神加封“顯靈”稱為“顯靈廣濟夫人”。廷佑年間，虞集登此山，見路毀亭荒，即鼓勵安慶府判李維肅新修此亭。天歷年間，又在廟南山門側立一鐵柱，長約三丈有余，系有鐵索，讓舟人攀援渡險。石上鐫有俞翰書的“海門第一關”，門首重書“啟秀寺”三字。

明代是小孤山寺廟鼎盛時期，洪武二年(1369)遣良工派官員，對寺廟進行維修和致祭，封女神為“天妃圣母”。永樂年間，封山神為“護國佑民妙靈昭應宏仁普濟天妃”并遣官司致祭。官致祭文曰：“維神下奠巨浸，砥柱中流，吳楚之鎮，畿甸之候。延攪萬里，享祀千秋，利有攸往，唯神是求。迄今祭奠，以迓神庥，尚響“。為安南兵事，成祖遣成國公朱能，英國公張輔，先后于永樂四年七月二十二日，永樂七年二月五日兩次祭山。宣德二年二月七日，又遣龔良上山致祭。弘治時期，邑令陳恪，施溥均對廟宇重新修葺。嘉靖九年(1532年)安慶知府葉夢熊予以維修，并刻詩文記述其事，至今尚存。亭改名“梳妝亭”被譽為天妃圣母梳妝處。二十六年(1547年)，因山小廟隘。敕別建天妃行宮于山西里許處，其磚瓦皆各地所獻，每片都刻有督造官的姓名。顏曰：“護國寺”，一進九重。中為“天妃殿”，規模龐大，雕梁畫棟，制度宏巨，儼若王居。院內有“御碑亭”刻有嘉靖的父親興獻帝詩一章。落成后，派官員致祭，有：在昔二圣曾此經過。顧覽神棲式展處，敬重以御題勒石，妝葺廟庭。珍器尚藏，用充—豆”等語，使小孤山名盛一時，可謂達到頂點。小孤山成為不是五岳的五岳，佛教活動也相應地發展起來。進入昌盛階段。后因歲久江坍，護國寺水毀無存，僅有部分碑文、石刻存于山上。

清代對此山廟宇，不斷加以修葺。順治九年(1652年)邑令孟宣興建小孤山山門和關帝閣。廟內住持寶慧，經過多年募資，把重樓余廡修制一新。康熙初，知縣王民皋，重建“護國寺”于故址東北處，與山上寺廟相互輝映。五十九年(1720年)詔令天下省州縣皆為天妃立廟，加封女神為“天后”。乾隆年間，山上寺廟日漸圮毀，總督高某奏請核準，廟于巳酉(1765年)重建，門首鐫有御書“靈昭江嶼”，亭由邑國子孫王傳璋重修。五十三年(1788年)又為天后加封“顯神贊順”四字。山僧西照還募砌石階于山麓，修石級至殿門，以便泊舟登山。咸豐年間，廟因年久失修又遭兵燹，狼籍不堪。丁巳七年(1857年)，彭玉麟視師江表，與彭友勝等，重修小孤山廟，碑記序云：“本來巾幗，靈爽千秋。道造無極，威鎮中流。水繞而曲，山峻而幽，江南妙境，此爭上游。年代已久，古剎云休，修理復舊，抑又何求“。并擴建了外舍，獻制了鐵香爐，匾對和石刻。

民國十二年(1923年)，七社集資，增修山寺北處的“護國寺”。后三年又將湮沒的御詩碑復制重建。移置小孤山絕頂梳妝亭后。此后二十多年中山僧龔明道還不斷化緣募資。對山上的廟宇作過多次增建和維修。

1949年建國后，政府對山上廟宇和文物石跡實行保護，64年安慶行署派工程隊前來，將山上的廟宇亭閣修葺一新，并添置了不少文物。1967年“文革”中橫掃“四舊”，山廟的建筑、佛像和文物屢遭破壞，宗教活動基本停止，只剩山上啟秀寺一座。此后十幾年中，山上寺廟全由僧人常聞、果成等人看守。十一屆三中全會后，政府恢復了宗教政策，由江西省調來的匡成老和尚與常聞、宏印。行義等人，把信眾供奉的香火錢積累起來，購置佛像、法器，新建大雄寶殿，并于圣母殿東邊山腰修建一座水塔。特別是1996年以后，住持匡成老和尚帶領監院釋行義，四處募集資金，新建藏經樓和僧舍，并對山上危樓進行大量維修。1998年釋行義接任住持，他又帶領僧眾，省吃儉用，攢下一點一滴的香火錢，建造平臺，維修山路，并在山門前增放一對三米多高的巨獅。2004年，他又在多方面的努力下，籌集資金，銀行貸款修新復舊的新建大雄寶殿、圣母殿、娘娘殿。至此，這座千年古剎在歷代僧侶和他的護持之下又煥然一新、初具規模。

由于啟秀寺位于長江絕島，山神被視作船只航行的保護神，又有一些美麗動人的傳說故事，因而游客、香客不斷。特別是古歷三月二十三日，小姑娘娘誕辰這天，游客、香客更是絡繹不絕的上山朝拜，以求平安，更給千年古寺注入了新的生機和活力。近年來，由于政府的重視，1984年安徽省人民政府確定小孤山啟秀寺為省級52座重點寺廟之首，山上石刻也被列入重點保護文物。這座古剎，歷經千年，在列朝政府和山僧的護持下，又恢復了昔日的雄姿。