中天竺法凈禪寺位于浙江省杭州市天竺山下。周圍有稽留、寶掌、中印、蓮花、月桂五峰環繞，如佛掌五指，拱托梵天；又如蓮花五葉，綻放西山。古剎則在佛掌蓮蕊之中，堪稱靈山寶地，佛國天然。《天平環宇記》所載：上古堯舜時，許由因不愿做官外逃，遁跡山林，曾在此隱居，故名“稽留峰”。又說東晉丹術家、道教理論家葛洪曾在此修煉，故名“葛塢”。法凈禪寺景色幽美，古樹掩映。在寺院對面的永清塢，有白云巖、玉液泉、馬腰嶺；寺北有楓木塢，古時這里楓樹成林，入秋時“赤城霞起”，層林盡染，為古代一景。楓木塢旁即葛塢。

法凈禪寺初建于隋朝。隋統一中國后，名僧紛紛南下。中印度高僧寶掌自魏晉開始東游，于隋開皇十七年(597年)到達杭州，對中天竺一代的景色十分贊美。他稱：“行盡支那四百川，此中偏稱道人游。”于是在此入定坐禪，建立道場。寶掌乃成為中天竺的開山始祖。寶掌于唐太宗顯慶二年(657年)在浦江化去，自稱至此已有1072歲，故中天竺有“千歲巖”。又因寶掌來自中印度，故又稱“中印峰”。隋仁壽中期(602——603年)，隋文帝曾給慧誕法師攜神尼舍利在飛來峰造飛來塔，越年塔成，遂留中天主持弘法。慧誕在中天竺研習攝論學派的《攝大乘論》，是為攝論宗師，名重當時，法席隆盛，為中天竺第代祖師。唐開無、大歷年間，先后由守直、法銑等法師住持；法銑為賢首宗創始人法藏的再傳弟子，于唐朝中期師從法藏弟子慧苑學法，精通《華嚴經》，于唐大歷中(766——7979年)住天竺時著有《刊定記纂釋》，指摘其師，自創一說；他還曾于大歷三年(768年)赴常州龍興寺講法，法席很盛。他的嗣法弟子有太初、正覺、神秀、澄觀等，均為當時名僧，先后住持中天竺名剎。其中澄觀為越南僧人，在天竺師從法銑，聽講覺凝，并在杭州譯著了不少佛經。貞元十二年(796年)奉詔入長安，協助罽賓國沙門般若翻譯《華嚴經》，成四十卷《華嚴》，后人尊澄觀為華嚴宗四祖。

宋太宗太平興國元年(976年)，吳越王錢弘俶在中天竺建寺，寺名“崇壽院”。宋時中天竺香火興盛，香客甚多，成為當時游覽名勝。時人題“中竺十二景”有：七星潭月、永景竹浪、獅崖晚色、天香月桂、千巖古意、竺領新桐、合澗沉鐘、盥漱松濤、稽留旭日、雙樹高峰、臥龍香翠、玉液重泉。文人騷客紛紛在此結社聚會，吟詠酬唱。

南宋定都臨安(杭州)，于紹興初(1131年前后)擴建中天竺禪寺殿宇，寺旁建有元妙舍利塔、三塔，并將宮中摩利支佛像移此，由堂法師住持。堂自幼在東京(今開封)奉先院出家，北宋宣和初年(1120年)由宋徽宗趙佶在慶基殿賜牒，祝發受具，并在三藏譯經處研習佛經，又曾向天寧寺圓悟法師求法。他隨宋氏南渡住持中天竺寺后，建華嚴閣，并開席講經，弘揚佛法，于淳熙中(1182年前后)奉召入內庭為宋孝宗講經。當時宋朝皇帝常去中天竺進香，故由僧錄司若納在水月池建水月樓，樓內寬敞宏麗，樓外環境幽雅，縉紳文人在該樓題詠甚多，后遭毀圮。南宋紹定、瑞平年間(1228——1236年)，由佛燈法師住持中天竺十二年，他曾奉旨

興建殿宇，使中于竺梵宇一新，宋理宗為表彰其功，曾御題其畫像稱“志宏兼愿，貌古神清”。佛燈于晚年遷

住寧波天童寺。南宋寶祐二年(1254年)，宋理宗再次撥內帑重修華嚴閣，同時修建神御殿，以供奉其父宋寧宗皇太后神位，并御憶“天寧萬壽永祚禪寺”寺額，以祈求永遠保持南宋國統。至寶祐五年(1257年)底又命住持佛照重新開鑿水月池。

元代朝廷為籠絡南宋高僧，元文宗圖鐵木爾于天歷年間(1328——1330年)，召見中天竺住持大訴(同欣)，賜予三品官階，封為“廣智全悟大師”，命其同時住持南京集慶寺和杭州中天竺，并將中天竺寺名改為“天歷永祚禪寺”。凡朝廷賞賜，大欣都用于介入葺寺院。大欣自幼熟讀史書，精研佛學，他在中天竺住持期退居“蒲庵”，著有《四會語靈》、《禪林法規》等，并有《蒲室集》等詩文著作。在至正年間，由廷俊住持天竺寺，整修殿宇，并著有《泊川集》等。大欣、廷俊等都為飽學儒僧，在他們先后住持下，中天竺曾盛極一時。元末時“天歷永祚禪寺”被毀。

明洪武初，中天竺重建，改名為“中天禪寺”。時名僧季潭宗泐住持該寺，禪門高賢紛紛來該寺住山。在朝廷命名地舉薦高行僧人時，宗泐居于首位。明太祖召見后命他住院金陵天蚧寺，并奉旨去西域取經，回朝后封為僧錄司左善世師，掌理全國佛門事務。當時明太祖還命宗泐撰寫“獻佛文章”，共成八章：善始、昭信、慈延、法喜、禪悅、編應、妙濟、善成。明太祖親閱后御署曲名，下令譜成曲調，稱為《贊佛樂章》，作為佛門定制。自此明太祖對宗泐更表崇敬。當時學士信濂信佛，而宗泐又頗具文學素養，故明太祖常喜稱他們為“宋和尚”、“泐秀才”，尊稱宗泐為“泐翁”。但宗泐對朝廷限佛和利用佛教已具誡心，因此，明太祖封他做官，他堅辭不受。當時，朝廷 要成產“善世院”，集中天下名僧，令宗泐發檄文至全國各名山表示擁戴，宗泐也只笑而不應。遂后他激流勇退，堅辭返杭。但歸后仍被遣送到安徽陽槎峰去終老。此后，中天竺在無旨可授等名僧住院持下，潛心弘傳凈土法門，也曾興盛一時。明朝中、后期，寺宇破敗，無力維修，香火也漸衰落。

清初，清帝康熙‘乾隆數下江南，也曾到中天竺進香。如康熙三十八年(1699年)，清帝玄燁在天竺三寺進香，并撥內帑修繕各寺。又于康熙四十三年(1703年)南巡時，曾至中天竺題寫“靈竺慈緣”匾額。乾隆三十年(1765年)春南巡時，為中天竺寺御題寺額，改寺名為“法凈禪寺”。但清初幾代帝王大多對上天竺觀音殿特別眷顧，對中、下天竺常常屬于順道巡視。法凈禪寺高僧輩出，但屢遭侵毀。現時規模為清光緒十八年(1892年)重修。當時寺內有天王殿、正殿、后殿、地藏殿、摩利支天殿(宋紹興初為伽藍殿)、神衣殿、白衣觀音堂；并建有桂子堂、天香閣、諸天閣、御書閣(藏御書匾額題字處)以及供寺僧退院養老的六房。寺院規模，相當宏偉。

民國以降，法運衰落，殿宇顛覆，金像補毀。1979年后時適盛世，政策落實，在十方檀越資助下，重建寺宇殿堂，廣傳佛法妙音，寺院佛事再度興盛。90年代初，重修梵剎，修復面積近千平方米，并興建安養堂，供老年僧尼安養終老。自1994年起，杭州市佛教協會會長俞昶熙在法凈禪寺為在家居士舉辦“佛學講座”百余次，聽眾已達五萬多人次。1998年開始創辦“杭州市僧伽培訓班”。該寺慧燈燃犀，三寶重光，法凈永祚。