蘇州園林主要為宅園，傳統文化十分注重宅園“風水”，蘇州園林在選址和布局上自然要尋找“風水佳穴”。

中國風水是地景崇拜的體現，講求人和宇宙的協調，用得較多的就是陰陽八卦和五行、四象之說，反映了中華古人對地質地理、生態、景觀、建筑等的綜合觀念，這是一種“天人合一”的地理觀，被西方科學家稱為“東方文化生態”。

“藏風聚氣”、“山環水抱”和“龍真穴的”被稱為“風水三要素”。例如，園林選址，風水術以四靈之地為理想的環境，它的構成模式完全套用五行四靈方位圖式，只是將四靈具體化為山（玄武）、河（青龍）、路（白虎）、池（朱雀）等環境要素。所謂左青龍、右白虎、前朱雀、后玄武，用的是相對方位，并非東西南北的絕對方位。

蘇州園林選址也以四神獸模式為最佳，如《陽宅十書》所言：“凡住宅左有流水謂之青龍，右有長道謂之白虎，前有污池謂之朱雀，后有丘陵謂之玄武，謂最貴地。”蘇州耦園，東（左）為流水，南（前）有河道，北（后）有藏書樓，樓后又為水，西（右）有大路，自然為大吉之地。

“八卦”是平面上八個方位之象，為四方位細分的派生物，因此，住宅大門是房子的嘴，主吸納靈氣，所以，園林住宅大門的朝向最為重要，一般坐北朝南，以八卦中的離（南）、巽（東南）、震（東）為三吉方，其中以東南為最佳，在風水中稱青龍門。門邊置屏墻，避免氣沖，屏墻呈不封閉狀，以保持“氣暢”。私家園林住宅的大門一般偏于東南，處于屬“木”的“巽”位，“巽”為“風”卦，水木相生，“風”為入，寓意財源滾滾而入，且向陽、通風。據說，民間認為東南風可以感受到平和恬淡、安詳淳樸的自然情調，所以風水最好。正南“離”卦，屬午火，陽氣最旺，唯“帝王”和“神”消受得起，一般人不避反傷，所以私家園林大門鮮有朝正南開者。

拙政園住宅部分位于山水園的南部，分成東西兩部分，呈前宅后園的格局。住宅坐北面南，縱深四進，有平行的兩路軸線，主軸線由隔河的影壁、船埠、大門、二門、轎廳、大廳和正房組成，側路軸線安排了鴛鴦花籃廳、花廳、四面廳、樓廳、小庭園等，兩路軸線之間以狹長的“避弄”隔開并連通。住宅大門偏東南，也避開了正南的子午線。避開正南開門的現象多見于明代和清代前期的建筑，到清代中、后期就不大講究了，如耦園大門朝正南而開。

風水學認為，“凡宅居滋潤光澤陽氣者吉，干燥無潤澤者兇”。住宅固然要求干燥，但周圍如果沒有溪水環繞，就斷絕了生機。

風水中符合醫學科學的內容也很多。例如，住宅建筑前屋低、后屋高的吉，符合人們對于光照的需要，陽光紫外線可以殺菌。大門前不可種大樹、獨樹和空心樹、瘦結如瘤之樹、藤蘿糾纏之樹等，以免阻擋陽光，阻撓陽氣生機進入屋內，屋內陰氣不易驅出。蘇州春在樓建筑在一條中軸線上，有門樓、前樓、中樓、樓脊，中樓高于前樓，前樓又高于門樓，呈“步步高、級級高”走向，既符合人的趨吉心理，又符合醫學科學。風水術對小環境的樹種選擇也甚為講究，如《相宅經纂》主張宅周植樹，“東種桃柳（益馬）、西種梔榆、南種梅棗（益牛）、北種柰杏”；又“中門有槐，富貴三世，宅后有榆，百鬼不近”，“宅東有杏兇，宅北有李、宅西有桃皆為淫邪”，“門庭前喜種雙棗，四畔有竹木青翠則進財”；還有“青松郁郁竹漪漪，色光容容好住基”之說，提倡種松竹。上述貌似迷信荒誕的吉兇說，卻頗符合科學，它既科學地根據不同樹種的生長習性規定栽種方向，有利于環境的改善，又滿足了改善宅旁小氣候觀賞的要求。“桃李羅堂前，榆柳陰后檐”，俗語稱：“樹木彎彎，清閑享福。桃株向門，蔭庇后昆；高樹般齊，早步云梯；竹木回環，家足衣綠；門前有槐，榮貴豐財。”蘇州園林對植物樹種的選擇就很講究，如網師園和獅子林都門庭前植槐，以符“槐門”之稱，大廳的前后種上金桂玉蘭，以合金玉滿堂。蘇州滄浪亭，草樹郁然，崇阜廣水，不類乎城市。雜花修竹之間有小路，三面環水，旁無居民，左右都有林木相遮蔽，前竹后水，水之陽又竹無窮極，澄川翠干，光影會合于軒戶之間，尤與風月為相宜。錢大昕《網師園記》曰：網師園“負郭臨流，樹木叢蔚，頗有半村半郭之趣。居雖近廛，而有云水相忘之樂”。園林中以松柏為主景的也很多，網師園的“看松讀畫軒”、拙政園的“聽松風處”、怡園的“松籟閣”都以松為主景。

噪音也是妨礙人體健康的大敵，所以，風水以為“不宜居大城門口及獄門、百川口去處”，因為那里人員雜沓，車馬聲、吆喝聲、呻吟聲，使人煩躁，甚至會引起失眠等癥狀。蘇州園林的主人大多以隱逸為旨趣，他們營造的是“居塵而出塵”的“城市山林”，相土選址以“地僻為勝”，“遠往來之通衢”，所以，蘇州園林都建在小巷深處，雜廁于民居之間。例如，網師園大門位于一條極窄的羊腸小巷闊家頭巷深處。因為園主筑園之初心，即藉以避大官之輿從也！藝圃位于文衙弄，不遠處就是曹雪芹《紅樓夢》中說的“紅塵中一二等風流繁華之地”的閶門，但卻有“隔斷城西市話嘩，幽棲絕似野人家”，要找到藝圃，非得有尋幽探芳的決心不可。

耦園僻處蘇州“城曲”小新橋巷，罕有車跡。拙政園東部明代末年是王心一的“歸田園居”，當年也是“門臨委巷，不容旋馬”，“委巷”即東首的百花小巷。號稱“吳中第一名園”的留園，位于蘇州閶門外，當時從城內出城去留園，都是狹窄的石子小道。留園東北是花埠里，北至半邊街、東鄰五福弄、西迄繡花弄，都是小巷。南面的留園路，原先也是小道。拙政園之地，早在唐詩人陸龜蒙所居之時，就是“不出郛郭，曠若郊野”。北宋時胡嶧居此，也是“宅舍如荒村”。明時仍有積水亙其間，頗具山野之氣。明代依然有“流水斷橋春草色，槿籬茆屋午雞聲”的野趣（文徵明《拙政園若墅堂》詩）。如今大門面對著人民路的怡園，原來大門也開在小巷。可以說，避開塵囂、“隔塵”、“隔凡”，贏來一份清幽，這是蘇州園林選址的共性。

蘇州在長期的造園實踐中，逐漸拂去了構園活動中濃重的迷信色彩，而強調了構園中符合人們的環境生態、環境心理的科學性和實際性，如明代計成在他的造園經典《園冶·立基》中明確地說：“選向非拘宅相。”認為園林的建筑布置、向背應該根據造園的立意，因地制宜，而不可完全為風水堪輿所迷惑。蘇州宋代的滄浪亭、明代的藝圃和清代的聽楓園，大門都朝向北面。蘇州大量的私家園林大門朝向是依街巷方向而定，與民宅并無二致；但在園內的整體結構上，基本上符合前朱雀（池）、后玄武（山或樓）、左青龍（河）、右白虎（大路）的相對方位。即使現在設計的新園林，也基本遵循此原則，大致以正廳、正房為主，正廳的朝向根據主人的生肖八字來定，變化多端，并無定則。

面水背山的環境自然是十分理想的生態環境。費爾巴哈講到過“一種精神的水療法”，認為“水不但是生殖和營養的一種物理手段……而且是心理和視覺的一種非常有效的藥品。涼水使視覺清明，一看到明凈的水，心里有多么爽快，使精神有多么清新！”水生植物也具有凈化水體、增進水質的清潔與透明度等功能，如蘆葦、水蔥、水花生、水葫蘆等不僅具有良好的耐污性，而且能吸收和富集水體中硫化物等有害物質，凈化水質。植物還可以防止硝酸鹽污染地下水。而植物茂密的青山引來飛禽走獸，帶來鳥語花香，春山淡冶如笑，宜游；夏山青翠欲滴，宜觀；秋山明凈如妝，宜登；冬山慘淡如睡，宜居，符合傳統養生學中“和于陰陽，調于四時”之說。